RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 ARSEP51690 589 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MLLT10P55197 1068 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 BECN1Q14457 450 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 LONP2Q86WA8 852 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PTOV1Q86YD1 416 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 RDM1Q8NG50 284 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 WDR20Q8TBZ3 569 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ABHD8Q96I13 439 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 FAM81BQ96LP2 452 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MIOSQ9NXC5 875 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 TAAR2Q9P1P5 351 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.04□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 LOC100509620A0A075B734 347 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 A0A0G2JNG1 304 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GLOD5A6NK44 160 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 A6NL46 340 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 C15orf62A8K5M9 175 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 H0YIN7 160 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 FIBPO43427 364 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SYNGR3O43761 229 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 LMX1BO60663 402 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CREG1O75629 220 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 KRT36O76013 467 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZNF432O94892 652 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 CSF2RAP15509 400 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZNF23P17027 643 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GJA1P17302 382 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MARK3P27448 753 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PSMC4P43686 418 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MMP15P51511 669 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SIRPAP78324 504 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GAGE2BQ13066 116 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PLA2G7Q13093 441 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PRKAA1Q13131 559 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MELKQ14680 651 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 KIR2DS5Q14953 304 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GAGE2EQ4V326 116 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SMPDL3BQ92485 455 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 LPGAT1Q92604 370 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 TMCO6Q96DC7 493 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GCNAQ96QF7 691 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A12Q96S37 553 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 EPYCQ99645 322 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 APOL6Q9BWW8 343 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 ZFP57Q9NU63 452 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.03□□□□□ -1.76
RBM39-211ENST00000426951 MAGEB17A8MXT2 336 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 BMPR1BO00238 502 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 TO15178 435 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 SSX4O60224 188 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 CTSVO60911 334 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 LMAN1P49257 510 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 ACCSLQ4AC99 568 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 ADALQ6DHV7 355 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 TEX38Q6PEX7 206 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 PACS1Q6VY07 963 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 SMIM29Q86T20 159 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
RBM39-211ENST00000426951 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms