RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381227.5

POLR2B-202, Transcript of RNA polymerase II subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene POLR2B, Length 4,108 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2B-202ENST00000381227 GPR141Q7Z602 305 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 SNX20Q7Z614 316 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 GALNT7Q86SF2 657 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 RETREG3Q86VR2 466 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 OFCC1Q8IZS5 231 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PHC3Q8NDX5 983 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CD200R1Q8TD46 325 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 TOP1MTQ969P6 601 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 TSSK3Q96PN8 268 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 SLC22A12Q96S37 553 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 BBS2Q9BXC9 721 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ASAH2Q9NR71 780 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PCTPQ9UKL6 214 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CCL16O15467 120 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 MTX2O75431 263 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 STK16O75716 305 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 WDR47O94967 919 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FKBP9O95302 570 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ZNF682O95780 498 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 IGLV3-27P01718 113 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 GSNP06396 782 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FGF4P08620 206 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ITPKAP23677 461 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 GNPDA1P46926 289 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ATP4BP51164 291 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 VAC14Q08AM6 782 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PLCL1Q15111 1095 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ADRM1Q16186 407 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 NADK2Q4G0N4 442 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 WBP2Q969T9 261 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PYCR2Q96C36 320 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 OR52E6Q96RD3 313 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 A0A0C4DFX4 3053 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FAM92AA1XBS5 289 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FAM234BA2RU67 622 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 EVPLLA8MZ36 301 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 MYO1DO94832 1006 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PGLSO95336 258 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 MSH3P20585 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 S100A3P33764 101 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 HMGCLP35914 325 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 HTR6P50406 440 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ARHGDIAP52565 204 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CDKL1Q00532 357 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PRKCQQ04759 706 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 NEDD8Q15843 81 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CHSY3Q70JA7 882 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FUNDC1Q8IVP5 155 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 OR2T12Q8NG77 320 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ELMO1Q92556 727 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 FATE1Q969F0 183 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ACDQ96AP0 544 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PDFQ9HBH1 243 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 DHRS7Q9Y394 339 aa6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 A0A1B0GTL3 188 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 AQP12BA6NM10 295 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 PITPNM1O00562 1244 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 EI24O14681 340 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ACOT8O14734 319 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CXCL14O95715 111 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 CLIC3O95833 236 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 C8AP07357 584 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 ACRP10323 421 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 LAG3P18627 525 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2B-202ENST00000381227 HNF1BP35680 557 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms