RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 WWP1Q9H0M0 922 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 TREX1Q9NSU2 369 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 POT1Q9NUX5 634 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 BFARQ9NZS9 450 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 OGFRQ9NZT2 677 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CACNA1BQ00975 2339 aa14.63□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CTAGE9A4FU28 777 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PLD2O14939 933 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 ZW10O43264 779 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 OR1I1O60431 355 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 POLBP06746 335 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 THRAP10827 490 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 ARNTP27540 789 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 ETV5P41161 510 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 HALP42357 657 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 NPY2RP49146 381 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 LIMK2P53671 638 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 EPHA4P54764 986 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PRAMEP78395 509 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 GPR18Q14330 331 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 ITIH4Q14624 930 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PACS1Q6VY07 963 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 AVL9Q8NBF6 648 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 HM13Q8TCT9 377 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 NCSTNQ92542 709 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PEX13Q92968 403 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 MFSD3Q96ES6 412 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 KIFC1Q9BW19 673 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 UCK1Q9HA47 277 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 KCND1Q9NSA2 647 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PISDQ9UG56 409 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.62□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 AP3B1O00203 1094 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 KRT37O76014 449 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 TNFSF15O95150 251 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 TYRP1P17643 537 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 NSG1P42857 185 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PTGIRP43119 386 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 GFERP55789 205 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 LSMEM2Q8N112 164 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 RSC1A1Q92681 617 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 FGF11Q92914 225 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 C12orf66Q96MD2 445 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SERPINB12Q96P63 405 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 COG4Q9H9E3 785 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SOX13Q9UN79 622 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 UBXN7O94888 489 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 AP2A2O94973 939 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CCL4P13236 92 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PDHA2P29803 388 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PREPP48147 710 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PTK6Q13882 451 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 PPP1R7Q15435 360 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 MCUQ8NE86 351 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.6□□□□□ -0.07
CSAG1-202ENST00000370287 SLCO2A1Q92959 643 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms