RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369301.3

NHLRC2-201, Transcript of NHL repeat containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene NHLRC2, Length 11,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2-201ENST00000369301 NRF1Q16656 503 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 AGPSO00116 658 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SLC2A1P11166 492 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CERS2Q96G23 380 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ZNF558Q96NG5 402 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 IFT27Q9BW83 186 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 STRADBQ9C0K7 418 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 VCPKMTQ9H867 229 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PCTPQ9UKL6 214 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CASZ1Q86V15 1759 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 WDR27A2RRH5 827 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ANKRD28O15084 1053 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PRKAB2O43741 272 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SCTRP47872 440 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 RDH10Q8IZV5 341 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 MOAP1Q96BY2 351 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 MYRFLQ96LU7 910 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.5□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 AP2A1O95782 977 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 TGFB3P10600 412 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 HTR2AP28223 471 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 DCDC1P59894 354 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 E2F1Q01094 437 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SP2Q02086 613 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CDRT15Q96T59 188 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 H3BNX3 289 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 FBLN1P23142 703 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 C19orf35Q6ZS72 473 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 RDH11Q8TC12 318 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 GLYATL1Q969I3 302 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SGK2Q9HBY8 427 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SQORQ9Y6N5 450 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ATP6AP2O75787 350 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PRAMEF1O95521 474 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 NFKB2Q00653 900 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 MALLQ13021 153 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 RADILQ96JH8 1075 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 C1orf109Q9NX04 203 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 VAPBO95292 243 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 NT5EP21589 574 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 HNF1BP35680 557 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 MAGEA3P43357 314 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 PNLIPRP1P54315 467 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 LRP8Q14114 963 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 NODALQ96S42 347 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 FFAR3O14843 346 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 GPR42O15529 346 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 CLCN5P51795 746 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 MELKQ14680 651 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 DHCR24Q15392 516 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 TMEM156Q8N614 296 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SEMA4DQ92854 862 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SNX27Q96L92 541 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ASPNQ9BXN1 380 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 ALG9Q9H6U8 611 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 USP17L7P0C7H9 530 aa8.49□□□□□ -1.05
NHLRC2-201ENST00000369301 MAGEA11P43364 429 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms