RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348227.4

WDR54-201, Transcript of WD repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene WDR54, Length 1,147 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR54-201ENST00000348227 CALML6Q8TD86 181 aa14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 COG4Q9H9E3 785 aa14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.66□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 FAM159BA6NKW6 160 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 IQCF5A8MTL0 148 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 NDUFS3O75489 264 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 F3P13726 295 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 PMLP29590 882 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ACADVLP49748 655 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 VSNL1P62760 191 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 DNAJC3Q13217 504 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GUSBP11Q6P575 273 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 GLRX5Q86SX6 157 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 LRRC6Q86X45 466 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 SFRP1Q8N474 314 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
WDR54-201ENST00000348227 QSOX1O00391 747 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 HAUS5O94927 633 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 FTH1P02794 183 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ESR1P03372 595 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 GSTA2P09210 222 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 OR56A5P0C7T3 313 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 CKMT1AP12532 417 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 PREPP48147 710 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 GBX1Q14549 363 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 METRNLQ641Q3 311 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 TTC1Q99614 292 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 RTKNQ9BST9 563 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 FUT8Q9BYC5 575 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ZFATQ9P243 1243 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 CDYLQ9Y232 598 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.64□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 KLHL33A6NCF5 533 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 SNX2O60749 519 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 SPAG6O75602 509 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 DKK1O94907 266 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 GSTM1P09488 218 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 VCLP18206 1134 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ITGB6P18564 788 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 FMO4P31512 558 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 CCR7P32248 378 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 STX2P32856 288 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 FASLGP48023 281 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 GSTM4Q03013 218 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 KYNUQ16719 465 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 PERM1Q5SV97 790 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 PIM3Q86V86 326 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 VRK3Q8IV63 474 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 PALM2Q8IXS6 379 aa14.63□□□□□ -0.07
WDR54-201ENST00000348227 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms