RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.81□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 AGAP5A6NIR3 686 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ANXA9O76027 345 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TTC23Q5W5X9 447 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 GLYATQ6IB77 296 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 BAG5Q9UL15 447 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 BTRCQ9Y297 605 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PTGESO14684 152 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 DYRK3O43781 588 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 CPZQ66K79 652 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 NIM1KQ8IY84 436 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 GTF2H4Q92759 462 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 VAPAQ9P0L0 249 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 RABGGTBP53611 331 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 CRYBA2P53672 197 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 CDH13P55290 713 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 Q5BKY6 102 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TAC4Q86UU9 113 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TTC3P53804 2025 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TNFRSF10AO00220 468 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ALBP02768 609 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 MTHFRP42898 656 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 GPR50Q13585 617 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SMUG1Q53HV7 270 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 FAHD1Q6P587 224 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SNX20Q7Z614 316 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PPTC7Q8NI37 304 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 POLE4Q9NR33 117 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 OBSL1O75147 1896 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 G3V2T6 193 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 KMOO15229 486 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 MT-CO1P00395 513 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 LINC00032P0C843 101 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 NCS1P62166 190 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TNFAIP1Q13829 316 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SPATA33Q96N06 139 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SLC22A3O75751 556 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 HOXC8P31273 242 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 VBP1P61758 197 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 FPGSQ05932 587 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 FAM171BQ6P995 826 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC190Q86UF4 302 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 INVSQ9Y283 1065 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 ANGPT2O15123 496 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 F9P00740 461 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 DAPP51397 102 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 GEMP55040 296 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PWP1Q13610 501 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PERM1Q5SV97 790 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXB4-201ENST00000332503 MLYCDO95822 493 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms