RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 GULP1Q9UBP9 304 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLON5A6NGN9 336 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 AP1G1O43747 822 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ADH1BP00325 375 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS4P49798 205 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DNASE1L2Q92874 299 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM131CQ96AQ9 280 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RILPQ96NA2 401 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52B2Q96RD2 323 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMOQ9BU70 441 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NUF2Q9BZD4 464 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 STX16O14662 325 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DIAPH2O60879 1101 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK14O94921 469 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 AP2A2O94973 939 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CBX6O95503 412 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DRD1P21728 446 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CRY1Q16526 586 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 Q7L0L9 218 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPN14A8MX76 684 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CFAP99D6REC4 459 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 E2F3O00716 465 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN6O43657 245 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CBSLP0DN79 551 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXB2P14652 356 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PAX7P23759 505 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CBSP35520 551 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NCALDP61601 193 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB16Q05516 673 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TTLL9Q3SXZ7 439 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CD274Q9NZQ7 290 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PCTPQ9UKL6 214 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 OARD1Q9Y530 152 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 VCANP13611 3396 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FFAR2O15552 330 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NUAK1O60285 661 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LILRB5O75023 590 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GPC4O75487 556 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC5CO95185 931 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINA6P08185 405 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CD72P21854 359 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHA3P29320 983 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR1P46091 355 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PRLHRP49683 370 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 HK2P52789 917 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FGL2Q14314 439 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TREML1Q86YW5 311 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PDPRQ8NCN5 879 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF225Q9UK10 706 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TAPBPO15533 448 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXA1P55317 472 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CLCQ05315 142 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CCINQ13939 588 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 E2F5Q15329 346 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms