RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GPC2Q8N158 579 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 KAT5Q92993 513 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MYDGFQ969H8 173 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GAD1Q99259 594 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GAL3ST1Q99999 423 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ITM2CQ9NQX7 267 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ASAH2Q9NR71 780 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A1B0GWJ7 208 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM149AA5PLN7 773 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC15A5A6NIM6 579 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CLN5O75503 358 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TGM6O95932 706 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IL7RP16871 459 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ALOX12P18054 663 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MSH3P20585 1137 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PIK3CBP42338 1070 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CLCNKAP51800 687 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 FPGSQ05932 587 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HYAL2Q12891 473 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IL18R1Q13478 541 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ASAH1Q13510 395 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CLCA4Q14CN2 919 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ANGPT1Q15389 498 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 GPR158Q5T848 1215 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 STEAP4Q687X5 459 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PHC2Q8IXK0 858 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IL31RAQ8NI17 732 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ST8SIA2Q92186 375 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RORBQ92753 470 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PTERQ96BW5 349 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 NMUR1Q9HB89 426 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 POLE3Q9NRF9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TLK1Q9UKI8 766 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.29□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CDK1P06493 297 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 THRBP10828 461 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CPB1P15086 417 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CPN2P22792 545 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IL1R2P27930 398 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 OXTRP30559 389 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RPL14P50914 215 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CXCR4P61073 352 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMC5P62195 406 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 BTN1A1Q13410 526 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 DAG1Q14118 895 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PLD3Q8IV08 490 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 VWA5B2Q8N398 1253 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 RTP4Q96DX8 246 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HYLS1Q96M11 299 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF577Q9BSK1 485 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 REG4Q9BYZ8 158 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IL22Q9GZX6 179 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 FAM83DQ9H4H8 585 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 USE1Q9NZ43 259 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 CDYLQ9Y232 598 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 TMX2Q9Y320 296 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 A0A0A6YYJ9 748 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 HSPA4LO95757 839 aa7.28□□□□□ -1.24
GTF2E1-201ENST00000283875 IFNB1P01574 187 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms