RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268673.11

PDPK1-201, Transcript of 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPK1, Length 4,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPK1-201ENST00000268673 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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PDPK1-201ENST00000268673 VILLO15195 856 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 MAGEA6P43360 314 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 SMIM11AP58511 58 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 PMS2P3Q13401 168 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 TIGD6Q17RP2 521 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.62□□□□□ -0.07
PDPK1-201ENST00000268673 SLC34A3Q8N130 599 aa14.62□□□□□ -0.07
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