RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 ATG16L2Q8NAA4 619 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 EXOC2Q96KP1 924 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MGAT4DA6NG13 374 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 C5orf58C9J3I9 102 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FFAR2O15552 330 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 C8GP07360 202 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ALOX5P09917 674 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NCK1P16333 377 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 IFNA8P32881 189 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ARSDP51689 593 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ZNF284Q2VY69 593 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 EML3Q32P44 896 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 EVPLQ92817 2033 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 K7EPI3 171 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 LDB2O43679 373 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 OR6B1O95007 311 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 C1RP00736 705 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SERPINB1P30740 379 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RFC2P35250 354 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FLT3LGP49771 235 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ABRQ12979 859 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GRB7Q14451 532 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SYVN1Q86TM6 617 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CARM1Q86X55 608 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ARL10Q8N8L6 244 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TIFAQ96CG3 184 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MOCOSQ96EN8 888 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 COPS8Q99627 209 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MGME1Q9BQP7 344 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CD300AQ9UGN4 299 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 PDE10AQ9Y233 779 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MTMR11A4FU01 709 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TARM1B6A8C7 271 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FTH1P02794 183 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 COX7A2P14406 83 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GPR15P49685 360 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TMBIM6P55061 237 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NR1D2Q14995 579 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ADGRF1Q5T601 910 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MICU2Q8IYU8 434 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TAGAPQ8N103 731 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 LIX1Q8N485 282 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 SYT17Q9BSW7 474 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TEX12Q9BXU0 123 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TRPS1Q9UHF7 1281 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 DHRS7Q9Y394 339 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TMED5Q9Y3A6 229 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 NME4O00746 187 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FBP2O00757 339 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 FFAR3O14843 346 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GPR42O15529 346 aa8.72□□□□□ -1.01
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HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF1O95521 474 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 LATS1O95835 1130 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TBX18O95935 607 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 EBLN1P0CF75 366 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 PRIM2P49643 509 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 GALK1P51570 392 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 CDKL1Q00532 357 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TPGS2Q68CL5 300 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-201ENST00000264345 TFAP2CQ92754 450 aa8.72□□□□□ -1.01
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