RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SEPT3Q9UH03 358 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PTGES3LE9PB15 166 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 OR7A17O14581 309 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 VPS26AO75436 327 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IGHA2P01877 340 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IL10P22301 178 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MAP7Q14244 749 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SPANXN4Q5MJ08 99 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PSKH2Q96QS6 385 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MGME1Q9BQP7 344 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 EBPLQ9BY08 206 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ASB8Q9H765 288 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LAMA1P25391 3075 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PP18 115 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PQY0 241 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GLUD1P00367 558 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FAM163BP0C2L3 166 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AGXTP21549 392 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 NR1H2P55055 460 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 BNIP3Q12983 259 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FRS2Q8WU20 508 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 NCLNQ969V3 563 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TADA1Q96BN2 335 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZNF599Q96NL3 588 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TSSK3Q96PN8 268 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TTPALQ9BTX7 342 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 BBS2Q9BXC9 721 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GALNT8Q9NY28 637 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SARDHQ9UL12 918 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CEP290O15078 2479 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LCHNA4D1U4 455 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 XYLBO75191 536 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ESRRBO95718 433 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IGLV3-27P01718 113 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 F11P03951 625 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TACR1P25103 407 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PIGAP37287 484 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FKBP1BP68106 108 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GPR17Q13304 367 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DERL2Q9GZP9 239 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AIG1Q9NVV5 245 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SUN2Q9UH99 717 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 VPS51Q9UID3 782 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PKP3Q9Y446 797 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TOR1BO14657 336 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TAPBPO15533 448 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ITPKAP23677 461 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC11A2P49281 568 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CCT8P50990 548 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DGKEP52429 567 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 DDI1Q8WTU0 396 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 UROC1Q96N76 676 aa8.54□□□□□ -1.04
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