RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 KRT35Q92764 455 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 FICDQ9BVA6 458 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 CROTQ9UKG9 612 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.61■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 MGAT4DA6NG13 374 aa20.6■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 TLE1Q04724 770 aa20.6■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 CD180Q99467 661 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ASB8Q9H765 288 aa20.6■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 RARRES3Q9UL19 164 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 TFR2Q9UP52 801 aa20.6■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.6■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PYGMP11217 842 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 CTNNA2P26232 953 aa20.59■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 ARL4DP49703 201 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PDE1BQ01064 536 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ACY1Q03154 408 aa20.59■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 OR2L2Q8NH16 312 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ACTL9Q8TC94 416 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ABHD17AQ96GS6 310 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.59■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 DET1Q7L5Y6 550 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 RNF31Q96EP0 1072 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 MAP3K3Q99759 626 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 WWP1Q9H0M0 922 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 LHX9Q9NQ69 397 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 POLHQ9Y253 713 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-201ENST00000250495 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 OR5K3A6NET4 321 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 RBP3P10745 1247 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 FOLR1P15328 257 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 ADRA1AP35348 466 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 CASRP41180 1078 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1CAP62136 330 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 BCL7AQ4VC05 210 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 OOSP2Q86WS3 158 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC45Q96CN5 670 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 C12orf66Q96MD2 445 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 APOL2Q9BQE5 337 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-201ENST00000250495 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.57■□□□□ 0.88
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