RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 CD86P42081 329 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 TBATAQ96M53 351 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 MPP6Q9NZW5 540 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SLC7A4O43246 635 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 HS6ST1O60243 411 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ACVR2AP27037 513 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 BMPR1AP36894 532 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 DGCR6Q14129 220 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ZNF691Q5VV52 312 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 FAM234BA2RU67 622 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 H3BRB1 525 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 GABRDO14764 452 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SNX2O60749 519 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 DGKQP52824 942 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 DGUOKQ16854 277 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 GALNT7Q86SF2 657 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 YIPF6Q96EC8 236 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 RDH12Q96NR8 316 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 HBEGFQ99075 208 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 NT5MQ9NPB1 228 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SUN2Q9UH99 717 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ASB1Q9Y576 335 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 MROH6A6NGR9 719 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 NDUFB5O43674 189 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 VPS4BO75351 444 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 FMO3P31513 532 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 CCR1P32246 355 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 MASP1P48740 699 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 DSC2Q02487 901 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 RAPSNQ13702 412 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ARMC8Q8IUR7 673 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 FNDC5Q8NAU1 212 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 OTUD5Q96G74 571 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 TMEM209Q96SK2 561 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SPC25Q9HBM1 224 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 COMMD8Q9NX08 183 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 GJB3O75712 270 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 UTS2BQ765I0 119 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 CAPSLQ8WWF8 208 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ZNF583Q96ND8 569 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ZNF599Q96NL3 588 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ACTL8Q9H568 366 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 DNAJB9Q9UBS3 223 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 U3KQV3 271 aa20.24■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 GPR32O75388 356 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PAGE1O75459 146 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 KCNK2O95069 426 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 MMP2P08253 660 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SERPINB1P30740 379 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ERVK-8P63133 956 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ITKQ08881 620 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 CDK5R2Q13319 367 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 KCTD2Q14681 263 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 LRIT3Q3SXY7 679 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 USE1Q9NZ43 259 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 COL1A2P08123 1366 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 ECI2O75521 394 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SEC24AO95486 1093 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 PEX11BO96011 259 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SLC2A3P11169 496 aa20.23■□□□□ 0.83
PMS1-222ENST00000639501 SPNP16150 400 aa20.23■□□□□ 0.83
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