RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637325.1

PNKP-228, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-228	ENST00000637325	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	UCK1	Q9HA47	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	C9orf172	C9J069	976 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCL22	O00626	93 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	LDB2	O43679	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	UBXN7	O94888	489 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	LIPC	P11150	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	BRAF	P15056	766 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TYRP1	P17643	537 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CD82	P27701	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	MC4R	P32245	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	FDFT1	P37268	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	XIAP	P98170	497 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	DMPK	Q09013	629 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	COPS8	Q99627	209 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	MGA	Q8IWI9	3026 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCZ1B	P86790	482 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	STYX	Q8WUJ0	223 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ART4	Q93070	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCDC78	A2IDD5	438 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	KLHL33	A6NCF5	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325		B4E171	279 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ETS1	P14921	441 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TSPAN7	P41732	249 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	RAB15	P59190	212 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CDH17	Q12864	832 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	GPR18	Q14330	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TGIF1	Q15583	401 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	RPE65	Q16518	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CCNG2	Q16589	344 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PNKP-228	ENST00000637325	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms