RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	LHX9	Q9NQ69	397 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	BLACE	A4D250	179 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GPR89B	P0CG08	455 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	VCL	P18206	1134 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ARL4D	P49703	201 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	AMZ2	Q86W34	360 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	KCND3	Q9UK17	655 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CST8	O60676	142 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	POLB	P06746	335 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FECH	P22830	423 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CCL11	P51671	97 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GPR19	Q15760	415 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	CPZ	Q66K79	652 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	IPMK	Q8NFU5	416 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-262	ENST00000628078	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TTLL8	A6PVC2	850 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RFPL1	O75677	317 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	COMT	P21964	271 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GNLY	P22749	145 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	HMGCL	P35914	325 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	SPAM1	P38567	509 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	XRCC4	Q13426	336 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MR1	Q95460	341 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	NRTN	Q99748	197 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	RELN	P78509	3460 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-262	ENST00000628078	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms