RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	AP5Z1	O43299	807 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TNF	P01375	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	NAXE	Q8NCW5	288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	DGAT2	Q96PD7	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	LIPE	Q05469	1076 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	POTEH	Q6S545	545 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ABHD13	Q7L211	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF639	Q9UID6	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2T12	Q8NG77	320 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	RFK	Q969G6	155 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	RCN3	Q96D15	328 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A0J9YYE9	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	PDPK1	O15530	556 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ACR	P10323	421 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ACVR2A	P27037	513 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	GRM5	P41594	1212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	CASP6	P55212	293 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	NFATC2	Q13469	925 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	NPAS2	Q99743	824 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	NDC1	Q9BTX1	674 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	AHCYL1	O43865	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	OR3A3	P47888	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	OR3A2	P47893	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SEC23A	Q15436	765 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	CCR10	P46092	362 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	RGS10	O43665	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TACR2	P21452	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ICAM3	P32942	547 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TNFRSF11B	O00300	401 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	THRB	P10828	461 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	NCK1	P16333	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC5A3	P53794	718 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	PLA2G16	P53816	162 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A0J9YVX5	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	FABP3	P05413	133 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ADRB2	P07550	413 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	SELENOV	P59797	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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