RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CDC14CA4D256 554 aa24.41■■□□□ 1.5
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PTPRF-216ENST00000617451 EPOP01588 193 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 FOLR1P15328 257 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 PMS2P54278 862 aa24.41■■□□□ 1.5
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PTPRF-216ENST00000617451 RPE65Q16518 533 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 ODF2Q5BJF6 829 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRF-216ENST00000617451 SIRPB2Q5JXA9 342 aa24.41■■□□□ 1.5
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PTPRF-216ENST00000617451 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.41■■□□□ 1.5
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PTPRF-216ENST00000617451 TEX19Q8NA77 164 aa24.41■■□□□ 1.5
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PTPRF-216ENST00000617451 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.51e-7■■■□□ 18.6
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PTPRF-216ENST00000617451 CHRNA6Q15825 494 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRF-216ENST00000617451 LDLRAP1Q5SW96 308 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRF-216ENST00000617451 GPRC6AQ5T6X5 926 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 METRNLQ641Q3 311 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 KMT5CQ86Y97 462 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC42Q96M95 316 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRF-216ENST00000617451 FCRL5Q96RD9 977 aa24.37■■□□□ 1.49
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