RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614136.1

SRSF3-205, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 3, human

Gene SRSF3, Length 2,376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF3-205	ENST00000614136	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RBBP8	Q99708	897 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SCML1	Q9UN30	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MYLK	Q15746	1914 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136		A0A1W2PQU0	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TPP1	O14773	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RFPL1	O75677	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	STMN1	P16949	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ITGAL	P20701	1170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CNTF	P26441	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	FOXN2	P32314	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GPR1	P46091	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CXCL12	P48061	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CD151	P48509	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CCT5	P48643	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SERPINB9	P50453	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SUOX	P51687	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	LIMK2	P53671	638 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ADPRH	P54922	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZXDA	P98168	799 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF460	Q14592	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	INPP5A	Q14642	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RASA2	Q15283	850 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	VPS11	Q9H270	941 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136		E5RI56	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PSMD11	O00231	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	CDK14	O94921	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TRIM16	O95361	564 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	C2	P06681	752 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	GM2A	P17900	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PSMA3	P25788	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	ACRV1	P26436	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	AKT1	P31749	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SRSF3-205	ENST00000614136	PTGER3	P43115	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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