RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 MFSD3Q96ES6 412 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 FETUBQ9UGM5 382 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GMEB1Q9Y692 573 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 C22orf31O95567 290 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 SMARCB1Q12824 385 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 E2F2Q14209 437 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 C10orf82Q8WW14 230 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GPR20Q99678 358 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TNS1-220ENST00000611415 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 PER2O15055 1255 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 COL6A1P12109 1028 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MAP2K5Q13163 448 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MED27Q6P2C8 311 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 PARGQ86W56 976 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 IKZF2Q9UKS7 526 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 POMPQ9Y244 141 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 SLIT3O75094 1523 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 C9JVG2 144 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 H3BM21 787 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 IRF6O14896 467 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 S100A6P06703 90 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 TACR2P21452 398 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 CERS6Q6ZMG9 384 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 OR10A6Q8NH74 314 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 TBATAQ96M53 351 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 BRINP2Q9C0B6 783 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 OR4F21O95013 312 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ADH1AP07327 375 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ZNF460Q14592 562 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 PDZD7Q9H5P4 517 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 EXO5Q9H790 373 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 RPIAP49247 311 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 CDH12P55289 794 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 TAF10Q12962 218 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 GJD3Q8N144 294 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 RFKQ969G6 155 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 GIMD1P0DJR0 217 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ITPKBP27987 946 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 SLC5A3P53794 718 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 TMC8Q8IU68 726 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 CLIP4Q8N3C7 705 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 PIGXQ8TBF5 258 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 NEK7Q8TDX7 302 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 HMCESQ96FZ2 354 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ZNF570Q96NI8 536 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 EBPLQ9BY08 206 aa11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MATN2O00339 956 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ADH1CP00326 375 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MMP3P08254 477 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ARL2P36404 184 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 DLG1Q12959 904 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 CYP1B1Q16678 543 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 AZIN2Q96A70 460 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 RNF31Q96EP0 1072 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 MNTQ99583 582 aa11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TNS1-220ENST00000611415 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms