RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SLC9A6	Q92581	669 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	IL6	P05231	212 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TIE1	P35590	1138 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	NR1D2	Q14995	579 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SMO	Q99835	787 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A9	O60656	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LAMP2	P13473	410 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A6	P19224	532 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A1	P22309	533 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A4	P22310	534 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A3	P35503	534 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A5	P35504	534 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HCRT	O43612	131 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PRKCG	P05129	697 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CCNA2	P20248	432 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	FECH	P22830	423 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	DGKE	P52429	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ATP12A	P54707	1039 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	COX10	Q12887	443 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	WDR26	Q9H7D7	661 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	C4BPB	P20851	252 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	AAGAB	Q6PD74	315 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151		U3KQV3	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SOD2	P04179	222 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TFPI	P10646	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	LGALS3BP	Q08380	585 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	BROX	Q5VW32	411 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	TRIB2	Q92519	343 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PTPN18	Q99952	460 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PRPS2	P11908	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	PCSK2	P16519	638 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	ACVRL1	P37023	503 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151		Q6ZVU0	165 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RAB18-208	ENST00000611151	AHI1	Q8N157	1196 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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