RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	NRIP1	P48552	1158 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPR143	P51810	404 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CD81	P60033	236 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PSMC6	P62333	389 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TUBA1B	P68363	451 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	COG7	P83436	770 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZXDB	P98169	803 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ECT2L	Q008S8	904 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SREBF2	Q12772	1141 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DLG1	Q12959	904 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KCNC3	Q14003	757 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT33B	Q14525	404 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NFATC4	Q14934	902 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DLG2	Q15700	870 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NTRK2	Q16620	822 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGSF11	Q5DX21	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	FRG2	Q64ET8	278 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PMS2CL	Q68D20	193 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SFR1	Q86XK3	245 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EMC1	Q8N766	993 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF114	Q8NC26	417 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	APPL2	Q8NEU8	664 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	QRFPR	Q96P65	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAFAH2	Q99487	392 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDO	Q99489	341 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CENPO	Q9BU64	300 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SIL1	Q9H173	461 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1RL	Q9NZP8	487 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PADI1	Q9ULC6	663 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PZP	P20742	1482 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP34	Q70CQ2	3546 aa		3.01	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLSCR5	A0PG75	271 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAP2K7	O14733	419 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANKRD28	O15084	1053 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MID1	O15344	667 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TUBB	P07437	444 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC00271	P0C7V0	271 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NR2F1	P10589	423 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MMP9	P14780	707 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	NNMT	P40261	264 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	LMAN1	P49257	510 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ART1	P52961	327 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ISL1	P61371	349 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMF1	P82094	1093 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC20A2	Q08357	652 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	SNTA1	Q13424	505 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	C18orf63	Q68DL7	685 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT74	Q7RTS7	529 aa		3	□□□□□ -1.93
NEDD4L-222	ENST00000588494	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		3	□□□□□ -1.93

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