RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581578.5

GPS1-215, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 4

Gene GPS1, Length 470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-215	ENST00000581578	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	FOXN2	P32314	431 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	MAPK9	P45984	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ACVR1	Q04771	509 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CYP4F3	Q08477	520 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	BCL7A	Q4VC05	210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF534	Q76KX8	674 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PIM3	Q86V86	326 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	AVL9	Q8NBF6	648 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	OR2L2	Q8NH16	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF592	Q92610	1267 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	GATA6	Q92908	595 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PEX13	Q92968	403 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ZMYND15	Q9H091	742 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SOX13	Q9UN79	622 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	AKAP13	Q12802	2813 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	KLHL33	A6NCF5	533 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578		F8W8V4	182 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	AGRP	O00253	132 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	TTI1	O43156	1089 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SGTA	O43765	313 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	NDUFS3	O75489	264 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	AP2A2	O94973	939 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CD1C	P29017	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SLC19A1	P41440	591 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	NSG1	P42857	185 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	FASLG	P48023	281 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	DMPK	Q09013	629 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CAMK2B	Q13554	666 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	KRT33B	Q14525	404 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ITIH4	Q14624	930 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	MAP9	Q49MG5	647 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PHF19	Q5T6S3	580 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	METRNL	Q641Q3	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	JAML	Q86YT9	394 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	MPP5	Q8N3R9	675 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	OR10G6	Q8NH81	332 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SLCO2A1	Q92959	643 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	TMEM74	Q96NL1	305 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SERPINB12	Q96P63	405 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	STRADB	Q9C0K7	418 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	WWP1	Q9H0M0	922 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	RDH14	Q9HBH5	336 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578		D6RAR5	112 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	OR1I1	O60431	355 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	CPNE6	O95741	557 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PROS1	P07225	676 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	OR56A5	P0C7T3	313 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	BRAF	P15056	766 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	AMD1	P17707	334 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PAM	P19021	973 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	PRLHR	P49683	370 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	INHBC	P55103	352 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	RPE65	Q16518	533 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	HM13	Q8TCT9	377 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-215	ENST00000581578	NCSTN	Q92542	709 aa		12.78	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms