RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577498.1

IFT20-204, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-204ENST00000577498 RNF112Q9ULX5 631 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CA14Q9ULX7 337 aa14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 A0A1W2PQU0 124 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 K7ESM1 405 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CDC7O00311 574 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 INPP4BO15327 924 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NUAK1O60285 661 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MTX2O75431 263 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MPC1LP0DKB6 136 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GABRG2P18507 467 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CCR7P32248 378 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KCNC1P48547 511 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SGCGQ13326 291 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GTF2H3Q13889 308 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 RCN2Q14257 317 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 DET1Q7L5Y6 550 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GPSM1Q86YR5 675 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PELI3Q8N2H9 469 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 DRC3Q9H069 523 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 BPTFQ12830 3046 aa14.91□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 STX16O14662 325 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ITM2AO43736 263 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KLK8O60259 260 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SUPT3HO75486 399 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CDK14O94921 469 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 IGLV3-19P01714 112 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MTHFD2P13995 350 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 IMPDH1P20839 514 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NAGLUP54802 743 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TRIM69Q86WT6 500 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CNDP1Q96KN2 507 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TRMOQ9BU70 441 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TEX101Q9BY14 249 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 SGK2Q9HBY8 427 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 THEGQ9P2T0 379 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 IKZF3Q9UKT9 509 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 GPR34Q9UPC5 381 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.9□□□□□ -0.02
IFT20-204ENST00000577498 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 KRBA1A5PL33 1030 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 NEMP2A6NFY4 417 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 LRRC72A6NJI9 287 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 UBXN8O00124 270 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 EBAG9O00559 213 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 GPC4O75487 556 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 HSPA4LO95757 839 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 PCCBP05166 539 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 GPR89BP0CG08 455 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TRIM23P36406 574 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 TPMTP51580 245 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 CCR3P51677 355 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 HK2P52789 917 aa14.89□□□□□ -0.03
IFT20-204ENST00000577498 CTSCP53634 463 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms