RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDX1P52945 283 aa5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADKP55263 362 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 PPARDQ03181 441 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 C1orf61Q13536 156 aa5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM14Q14142 442 aa5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 NFATC4Q14934 902 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 DCUN1D2Q6PH85 259 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 WDR48Q8TAF3 677 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 LGMNQ99538 433 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 PCDH12Q9NPG4 1184 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.05□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 LRCH4O75427 683 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 PALMO75781 387 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ANXA6P08133 673 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ALPIP09923 528 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 GZMAP12544 262 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 GM2AP17900 193 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERCC2P18074 760 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 PSMA2P25787 234 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 HTR1BP28222 390 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINA4P29622 427 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 MIPP30301 263 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 HCAR3P49019 387 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 UCNP55089 124 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMPRSS3P57727 454 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIAA1024LP59773 190 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 IL10RBQ08334 325 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 MTM1Q13496 603 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 DPYSQ14117 519 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 ELOCQ15369 112 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 ASIC2Q16515 512 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 FILIP1LQ4L180 1135 aa5.04□□□□□ -1.6
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TRAPPC8-202ENST00000577426 ERMARDQ5T6L9 678 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 BROXQ5VW32 411 aa5.04□□□□□ -1.6
TRAPPC8-202ENST00000577426 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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