RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNMB4Q86W47 210 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CILP2Q8IUL8 1156 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35F3Q8IY50 421 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRN4CLQ8ND94 238 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP36Q96G28 342 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS37BQ9H9H4 285 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAC1Q9HBJ0 212 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAYSD1Q9NPB0 183 aa32.57■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVA1BQ9NVM1 165 aa32.57■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CKMT1AP12532 417 aa32.56■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPIAP49247 311 aa32.56■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR156Q8NFN8 814 aa32.56■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM167BQ9BTA0 163 aa32.56■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 GULP1Q9UBP9 304 aa32.56■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS21Q9Y6M0 314 aa32.56■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR56A5P0C7T3 313 aa32.55■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KYQ8NBH2 561 aa32.55■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CERS2Q96G23 380 aa32.55■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa32.55■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa32.54■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSTM1P09488 218 aa32.54■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSTM4Q03013 218 aa32.54■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC25Q86WR0 208 aa32.54■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAGSQ8N159 534 aa32.54■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NCN8 305 aa32.53■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOXF2BP0C7M4 288 aa32.53■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 F3P13726 295 aa32.53■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC6Q86X45 466 aa32.53■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-10P10266 1014 aa32.52■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf28Q4W4Y0 310 aa32.52■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFTPA2Q8IWL1 248 aa32.52■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RY12Q9H244 342 aa32.52■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PADI4Q9UM07 663 aa32.52■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EML2O95834 649 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYF5P13349 255 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP32.51■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 METRNLQ641Q3 311 aa32.51■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PALM2Q8IXS6 379 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFT20Q8IY31 132 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 HM13Q8TCT9 377 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 WASH6PQ9NQA3 447 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GNPTGQ9UJJ9 305 aa32.51■■■□□ 2.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC1A2P43004 574 aa32.51■■■□□ 2.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACADVLP49748 655 aa32.51■■■□□ 2.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP128Q6ZU80 1094 aa32.51■■■□□ 2.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNTN4Q8IWV2 1026 aa32.51■■■□□ 2.79
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6C4Q8NGE1 309 aa32.51■■■□□ 2.79
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