RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	C9orf172	C9J069	976 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	LIPC	P11150	499 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	RALB	P11234	206 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	CCL4	P13236	92 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	ITGAL	P20701	1170 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	MPST	P25325	297 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	TSPAN7	P41732	249 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	HAL	P42357	657 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	GPR33	Q49SQ1	333 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	NCSTN	Q92542	709 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKD1-231	ENST00000566784	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	AGRP	O00253	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	UBXN7	O94888	489 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SUN1	O94901	812 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	C9	P02748	559 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PSMA3	P25788	255 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MC4R	P32245	332 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MAPK9	P45984	424 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCNG2	Q16589	344 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	BMPER	Q8N8U9	685 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	STYX	Q8WUJ0	223 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ATRX	P46100	2492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784		K7ENP7	123 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SGTA	O43765	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	IFNB1	P01574	187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TPH1	P17752	444 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CAPZB	P47756	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PRLHR	P49683	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RAB15	P59190	212 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CDH17	Q12864	832 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GPR18	Q14330	331 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	POU6F1	Q14863	301 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RPE65	Q16518	533 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ART4	Q93070	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	COPS8	Q99627	209 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PAK5	Q9P286	719 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	EFCAB7	A8K855	629 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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