RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARL4CP56559 192 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLRN1P58418 232 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZXDBP98169 803 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITKQ08881 620 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 WASHC5Q12768 1159 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBTB17Q13105 803 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPARCL1Q14515 664 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNJ11Q14654 390 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLMAPQ14BN4 828 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 MORF4L2Q15014 288 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 DUSP6Q16828 381 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL31Q6EBC2 164 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 PID1Q7Z2X4 250 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 NLRP14Q86W24 1093 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 TDHQ8IZJ6 230 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC9A6Q92581 669 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 TIFAQ96CG3 184 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 HDAC11Q96DB2 347 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 RTP4Q96DX8 246 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 C9orf72Q96LT7 481 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA13Q96N96 652 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZIM3Q96PE6 472 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 LMAN2LQ9H0V9 348 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCL26Q9Y258 94 aa5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 H0Y626 953 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 J3KR12 359 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP2K7O14733 419 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHADO15335 359 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 LINC01565O15544 149 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP8B1O43520 1251 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 AVILO75366 819 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MOSPD3O75425 235 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRAMEF12O95522 483 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 OLFM2O95897 454 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHBGP04278 402 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCNB1P14635 433 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCNCP24863 283 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOXA9P31269 272 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 FDFT1P37268 417 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAGEA4P43358 317 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 NDST2P52849 883 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDH4P55283 916 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP10-11P60412 298 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC7A9P82251 487 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MXRA7P84157 204 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPS2Q13227 327 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTA1Q13330 715 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 OLIG2Q13516 323 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 KYNUQ16719 465 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 AFMIDQ63HM1 303 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 DENND2CQ68D51 928 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 C4orf22Q6V702 233 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CENPUQ71F23 418 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR149Q86SP6 731 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOOK3Q86VS8 718 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-202ENST00000559357 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms