RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 SEPT6Q14141 434 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 NFE2L1Q14494 772 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 CLCA4Q14CN2 919 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RPS6KA1Q15418 735 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 MANEAQ5SRI9 462 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 KCTD11Q693B1 232 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 PLXDC1Q8IUK5 500 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ULK4Q96C45 1275 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SGF29Q96ES7 293 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 DCUN1D1Q96GG9 259 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 FAM96AQ9H5X1 160 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 FAM8A1Q9UBU6 413 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 PSMD13Q9UNM6 376 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 BPTFQ12830 3046 aa18.07■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 B4E171 279 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 STMND1H3BQB6 276 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 CCL22O00626 93 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 PSMD3O43242 534 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 LDB2O43679 373 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC175P0C221 793 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RALBP11234 206 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 TPH1P17752 444 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 TSPAN7P41732 249 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 GFERP55789 205 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RAB15P59190 212 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 XIAPP98170 497 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RHDQ02161 417 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 VASH2Q86V25 355 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 NAT14Q8WUY8 206 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 DDA1Q9BW61 102 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SLC40A1Q9NP59 571 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 LOC400499M0QZD8 3231 aa18.06■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 CFAP99D6REC4 459 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 LIASO43766 372 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 AP2A1O95782 977 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 IFNB1P01574 187 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 MC4RP32245 332 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 GPR18Q14330 331 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 POU6F1Q14863 301 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 DCAF12Q5T6F0 453 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ANKS6Q68DC2 871 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SNX20Q7Z614 316 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 NXPE1Q8N323 547 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 C1orf54Q8WWF1 131 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SLC39A7Q92504 469 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 TGM7Q96PF1 710 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 OGFRQ9NZT2 677 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF148Q9UQR1 794 aa18.05■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 MGAT4DA6NG13 374 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ERVH48-1M5A8F1 160 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 NRDCO43847 1150 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 STIP1P31948 543 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 LMAN1P49257 510 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ATP1A2P50993 1020 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 SNX1Q13596 522 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RPE65Q16518 533 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 BCL7AQ4VC05 210 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 LINC00523Q86TU6 105 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 BMPERQ8N8U9 685 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 GPR150Q8NGU9 434 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RSC1A1Q92681 617 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RTP4Q96DX8 246 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 COPS8Q99627 209 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 CTRCQ99895 268 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 C19orf43Q9BQ61 176 aa18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa18.03■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC78A2IDD5 438 aa18.03■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 E7EVH7 732 aa18.03■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 RASSF9O75901 435 aa18.03■□□□□ 0.48
NEDD1-208ENST00000555806 C9P02748 559 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms