RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554666.5

PAPOLA-209, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-209	ENST00000554666	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZBTB43	O43298	467 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	LIPF	P07098	398 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	LIF	P15018	202 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	GNAZ	P19086	355 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	NFKBIA	P25963	317 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ITGA3	P26006	1051 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	MSH2	P43246	934 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	GALC	P54803	685 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ANO5	Q75V66	913 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	PXK	Q7Z7A4	578 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	PTOV1	Q86YD1	416 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	OR2A14	Q96R47	310 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	SH2D4A	Q9H788	454 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	NENF	Q9UMX5	172 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666		A0A087X0M5	115 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666		A0A1B0GX30	115 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ANTXRL	A6NF34	631 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666		J3KRW8	73 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	NR5A2	O00482	541 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	CSPG5	O95196	566 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	KCNK5	O95279	499 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	FAM157C	P0CG43	387 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	MPP1	Q00013	466 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	CRYM	Q14894	314 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	SLC22A12	Q96S37	553 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	SMC6	Q96SB8	1091 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	HS6ST1	O60243	411 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	CLPTM1	O96005	669 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	GH2	P01242	217 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	MAN1A1	P33908	653 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ARL3	P36405	182 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	SPOCK1	Q08629	439 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	MED22	Q15528	200 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	MEP1A	Q16819	746 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	PLD3	Q8IV08	490 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	TEX11	Q8IYF3	940 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	PDILT	Q8N807	584 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	OR2T12	Q8NG77	320 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	SETD4	Q9NVD3	440 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		3.78	□□□□□ -1.8
PAPOLA-209	ENST00000554666	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666		A0A1B0GU03	582 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666		A6NL46	340 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666		J3QR06	171 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	NDUFS4	O43181	175 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	PLPP2	O43688	288 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	EML2	O95834	649 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	TBX18	O95935	607 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	KRT19	P08727	400 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	KCNJ10	P78508	379 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	MAMLD1	Q13495	774 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PAPOLA-209	ENST00000554666	TUBB2A	Q13885	445 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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