RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ZNF547Q8IVP9 402 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TTC13Q8NBP0 860 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 IPMKQ8NFU5 416 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 HES6Q96HZ4 224 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ZPBPQ9BS86 351 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 UCK1Q9HA47 277 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 ARNT2Q9HBZ2 717 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 SMOXQ9NWM0 555 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PLAAQ9Y263 795 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PRKAB1Q9Y478 270 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-221ENST00000550734 BLACEA4D250 179 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 C5orf60A6NFR6 353 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 CDK14O94921 469 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 ACP5P13686 325 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 MC1RQ01726 317 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 HHEXQ03014 270 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 KLRB1Q12918 225 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 BIRC2Q13490 618 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 ITGA9Q13797 1035 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 ALS2CLQ60I27 953 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 LRRTM4Q86VH4 590 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SPATA13Q96N96 652 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 KCNK6Q9Y257 313 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 CREBBPQ92793 2442 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 MACROD2A1Z1Q3 448 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 LILRA5A6NI73 299 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 AGAP14A8MT82 685 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 KCNN4O15554 427 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 AGTP01019 485 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 PRKAR1AP10644 381 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SPAM1P38567 509 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 PDE1BQ01064 536 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 DMPKQ09013 629 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 PRPSAP1Q14558 356 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 DEFB109BQ30KR1 87 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 AADACL2Q6P093 401 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 FAM129CQ86XR2 697 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 OR10G6Q8NH81 332 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 PRDM8Q9NQV8 689 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 KLC4Q9NSK0 619 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SLC23A2Q9UGH3 650 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 PKP3Q9Y446 797 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 KLHL33A6NCF5 533 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 C2orf81A6NN90 581 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 DLGAP3O95886 979 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SLC4A1P02730 911 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 PSMB4P28070 264 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 GSDMDP57764 484 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 SEPT6Q14141 434 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 MAP7Q14244 749 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 CHRNA6Q15825 494 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-221ENST00000550734 PARP6Q2NL67 630 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms