RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RAPH1Q70E73 1250 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TRABD2AQ86V40 505 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 AMZ2Q86W34 360 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PARGQ86W56 976 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DCLK2Q8N568 766 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.18□□□□□ -0.94
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CS-220ENST00000550700 TMEM159Q96B96 161 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.18□□□□□ -0.94
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CS-220ENST00000550700 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GPAMQ9HCL2 828 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ZNF446Q9NWS9 450 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 KLQ9UEF7 1012 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TBK1Q9UHD2 729 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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CS-220ENST00000550700 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DHRS7Q9Y394 339 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 OR1A2Q9Y585 309 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 A0A096LPK6 155 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PR77 199 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PRSS38A1L453 326 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 HRO43593 1189 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 KDM1AO60341 852 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TRIM16O95361 564 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 RPN2P04844 631 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC2A4P14672 509 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 AOAHP28039 575 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MAGEA12P43365 314 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ARHGAP8P85298 464 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 B4GALNT1Q00973 533 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PPARDQ03181 441 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SYTL3Q4VX76 610 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.17□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.17□□□□□ -0.94
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CS-220ENST00000550700 COPEO14579 308 aa9.16□□□□□ -0.94
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CS-220ENST00000550700 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DNAJC6O75061 913 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GLRA3O75311 464 aa9.16□□□□□ -0.94
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