RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 FOXM1Q08050 763 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 RANBP10Q6VN20 620 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ZNF547Q8IVP9 402 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ZNF843Q8N446 348 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 NKD1Q969G9 470 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 C9orf72Q96LT7 481 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 TGM7Q96PF1 710 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 SMOXQ9NWM0 555 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ARL5AQ9Y689 179 aa16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 OR2AG2A6NM03 316 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 GAS8O95995 478 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 DMPKQ09013 629 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 LY6DQ14210 128 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 KRT33BQ14525 404 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 PLCL1Q15111 1095 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 PARP6Q2NL67 630 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 P3H1Q32P28 736 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 APOL2Q9BQE5 337 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 TSGA10Q9BZW7 698 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 SPTA1P02549 2419 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 SDK2Q58EX2 2172 aa16.6■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 C9P02748 559 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 CDC25BP30305 580 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ARL4DP49703 201 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 MC1RQ01726 317 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 GPR18Q14330 331 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 GSE1Q14687 1217 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 IRGCQ6NXR0 463 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 BMPERQ8N8U9 685 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 ALG3Q92685 438 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 RTP4Q96DX8 246 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 CTRCQ99895 268 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.59■□□□□ 0.25
CASP9-211ENST00000546969 MGAT4DA6NG13 374 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 ADRA1AP35348 466 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 CAPZBP47756 277 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 SEPHS1P49903 392 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 IL11RAQ14626 422 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 CLCA4Q14CN2 919 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 PCSK4Q6UW60 755 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 DET1Q7L5Y6 550 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 ESX1Q8N693 406 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 SPC24Q8NBT2 197 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 CATSPER2Q96P56 530 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 COPS8Q99627 209 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 FAM117AQ9C073 453 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.58■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 KRT86O43790 486 aa16.57■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 C1QL1O75973 258 aa16.57■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 STK17BO94768 372 aa16.57■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 FTCDO95954 541 aa16.57■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 BRAFP15056 766 aa16.57■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 NDUFS1P28331 727 aa16.57■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 CTSCP53634 463 aa16.57■□□□□ 0.24
CASP9-211ENST00000546969 GFERP55789 205 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms