RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FANCEQ9HB96 536 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR70Q9NW82 654 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ATXN10Q9UBB4 475 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PISDQ9UG56 409 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNK6Q9Y257 313 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL5AQ9Y689 179 aa5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEB16A2A368 324 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ENO4A6NNW6 628 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 B4E171 279 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 H7C0S8 307 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 LIASO43766 372 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RASSF9O75901 435 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UBXN7O94888 489 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FGGP02679 453 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MT-ND3P03897 115 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 APRTP07741 180 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ADRA1AP35348 466 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN7P41732 249 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPK9P45984 424 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CD151P48509 253 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NPY2RP49146 381 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TTPAP49638 278 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CSRP3P50461 194 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 B4GALNT1Q00973 533 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ADCY2Q08462 1091 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DMPKQ09013 629 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ITIH4Q14624 930 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TMED2Q15363 201 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CHRNA6Q15825 494 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 BCL7AQ4VC05 210 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SYTL3Q4VX76 610 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MANEAQ5SRI9 462 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 GPRC6AQ5T6X5 926 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.51□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PCGF5Q86SE9 256 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CLEC14AQ86T13 490 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM74Q86UV6 250 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM129CQ86XR2 697 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 KMT5CQ86Y97 462 aa5.51□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 NAGSQ8N159 534 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 NXPE1Q8N323 547 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 MPP5Q8N3R9 675 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC30BQ8N4P2 665 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2L2Q8NH16 312 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND1AQ8TEH3 1009 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC14L1Q92503 715 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 UBXN4Q92575 508 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 WBP1Q96G27 269 aa5.51□□□□□ -1.53
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CLSTN3-215ENST00000544584 NSMCE3Q96MG7 304 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FOPNLQ96NB1 174 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CD180Q99467 661 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 AGAP2Q99490 1192 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DDA1Q9BW61 102 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM117AQ9C073 453 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE7BQ9NP56 450 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A1Q9NY26 324 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 POLG2Q9UHN1 485 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 TFR2Q9UP52 801 aa5.51□□□□□ -1.53
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.51□□□□□ -1.53
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