RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	UBXN7	O94888	489 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	RALB	P11234	206 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	AMD1	P17707	334 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CXCR5	P32302	372 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	HADHA	P40939	763 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MAPK9	P45984	424 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MAP7	Q14244	749 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TGIF1	Q15583	401 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	RANBP10	Q6VN20	620 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF605	Q86T29	641 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF843	Q8N446	348 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ULK4	Q96C45	1275 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	RTP4	Q96DX8	246 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MGA	Q8IWI9	3026 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MTX2	O75431	263 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PRAMEF1	O95521	474 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MSH3	P20585	1137 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MPST	P25325	297 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ADRA1A	P35348	466 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	UGT1A3	P35503	534 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC19A1	P41440	591 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CHRNA4	P43681	627 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CAPZB	P47756	277 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CHRNA6	Q15825	494 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	P3H1	Q32P28	736 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC35F6	Q8N357	371 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF398	Q8TD17	642 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	NKD1	Q969G9	470 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	C9orf72	Q96LT7	481 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CATSPER2	Q96P56	530 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FICD	Q9BVA6	458 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SDK2	Q58EX2	2172 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MGAT4D	A6NG13	374 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CFAP99	D6REC4	459 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	AGRP	O00253	132 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PSMD3	O43242	534 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	KALRN	O60229	2985 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CEP104	O60308	925 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	RAD1	O60671	282 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	AGT	P01019	485 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	FGG	P02679	453 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	PRB1	P04280	392 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	BRAF	P15056	766 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	AKT1	P31749	480 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	MC1R	Q01726	317 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ABHD18	Q0P651	414 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	OLIG2	Q13516	323 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	IL11RA	Q14626	422 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKS6	Q68DC2	871 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CARF	Q8N187	725 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ABCC3-208	ENST00000506464	CD180	Q99467	661 aa		12	□□□□□ -0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms