RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-208ENST00000497842 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 CTSCP53634 463 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 LYSMD4Q5XG99 296 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 IQCHQ86VS3 1027 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 CEP97Q8IW35 865 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 KRT222Q8N1A0 295 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ZBTB44Q8NCP5 570 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 GPR21Q99679 349 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 TMEM202A6NGA9 273 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 FOXO6A8MYZ6 492 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 CHUKO15111 745 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 KPNA5O15131 536 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 CEACAM5P06731 702 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 GSTM1P09488 218 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 THEGLP0DJG4 465 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 GSTM4Q03013 218 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 OVGP1Q12889 678 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 PLK5Q496M5 336 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 LRRTM4Q86VH4 590 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 OR56A4Q8NGH8 313 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 FAM136AQ96C01 138 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 TLCD1Q96CP7 247 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 CCM2Q9BSQ5 444 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 TM9SF3Q9HD45 589 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 KLHL42Q9P2K6 505 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 MED16Q9Y2X0 877 aa28.09■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 A0A096LPK6 155 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 TNFRSF10CO14798 259 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 PYGBP11216 843 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ITGB6P18564 788 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ENPP7Q6UWV6 458 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 PIM3Q86V86 326 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 SMC6Q96SB8 1091 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 LATS2Q9NRM7 1088 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 MOSPD1Q9UJG1 213 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ACOT9Q9Y305 439 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 DHRS7Q9Y394 339 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 ACTL7BQ9Y614 415 aa28.08■■■□□ 2.09
TTC19-208ENST00000497842 A0A087X1B8 175 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 KMOO15229 486 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 GRID2O43424 1007 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 DNAJC6O75061 913 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 C2P06681 752 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 KRT4P19013 534 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 CLCN7P51798 805 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 TTLL9Q3SXZ7 439 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 TTMPQ5BVD1 217 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 KCTD16Q68DU8 428 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 CRTC3Q6UUV7 619 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 OTOAQ7RTW8 1153 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 EXOC3L1Q86VI1 746 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 C1orf216Q8TAB5 229 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 INPP5DQ92835 1189 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 VPS11Q9H270 941 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 GPAMQ9HCL2 828 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 GPR27Q9NS67 375 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa28.07■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 DCHS1Q96JQ0 3298 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 PRSS38A1L453 326 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 GOLGA8RI6L899 631 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 ZNF460Q14592 562 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 GALNT13Q8IUC8 556 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 SKA1Q96BD8 255 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 SYTL2Q9HCH5 934 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 FGF22Q9HCT0 170 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 PCMTD2Q9NV79 361 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 KLQ9UEF7 1012 aa28.06■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 A0A1W2PR77 199 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 KLHL33A6NCF5 533 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 LILRB5O75023 590 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 SLC35E2BP0CK96 405 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 ITPKAP23677 461 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 CSRP3P50461 194 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 PPM1JQ5JR12 505 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 ZNF547Q8IVP9 402 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 C4orf33Q8N1A6 199 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 ZBTB2Q8N680 514 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 CD200R1Q8TD46 325 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 ELMO1Q92556 727 aa28.05■■■□□ 2.08
TTC19-208ENST00000497842 GALPQ9UBC7 116 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms