RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 WNT1P04628 370 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PRSS56P0CW18 603 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CD9P21926 228 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 HALP42357 657 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SERPINB8P50452 374 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 RPA4Q13156 261 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DNAJC3Q13217 504 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ALG11Q2TAA5 492 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KIF19Q2TAC6 998 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PYCR3Q53H96 274 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 HDXQ7Z353 690 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ELMO1Q92556 727 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SGF29Q96ES7 293 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PDXPQ96GD0 296 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CABS1Q96KC9 395 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 BOCQ9BWV1 1114 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 P2RY12Q9H244 342 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KDM1AO60341 852 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 OR1I1O60431 355 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TCEA3O75764 348 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 HAUS5O94927 633 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ITGA2BP08514 1039 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZNF806P0C7X5 589 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ACP5P13686 325 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 STMN1P16949 149 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 IDSP22304 550 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 RXRGP48443 463 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CLCNKAP51800 687 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 B4GALNT1Q00973 533 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DMPKQ09013 629 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 RASA2Q15283 850 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CNSTQ6PJW8 725 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 LAYNQ6UX15 382 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TDRPQ86YL5 185 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 OR2L2Q8NH16 312 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 GLMNQ92990 594 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 FOPNLQ96NB1 174 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 GPR22Q99680 433 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PLAAQ9Y263 795 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 VWA7Q9Y334 891 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 OR5K4A6NMS3 321 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 PROB1E7EW31 1015 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 AQP9O43315 295 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 RPN2P04844 631 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ANXA6P08133 673 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ZNF883P0CG24 379 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CBSLP0DN79 551 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 DGKAP23743 735 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CRABP2P29373 138 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CBSP35520 551 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ACTR1BP42025 376 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 CTSCP53634 463 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ACTR1AP61163 376 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 ARHGAP8P85298 464 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 BIRC2Q13490 618 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-213ENST00000493945 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.064e-36■■■■■ 47.9
ACTB-213ENST00000493945 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms