RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 XKR4Q5GH76 650 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SDHAF4Q5VUM1 108 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TPGS2Q68CL5 300 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ADALQ6DHV7 355 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 JADE1Q6IE81 842 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 VITQ6UXI7 678 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ALKAL1Q6UXT8 129 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PIP4P1Q86T03 277 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 METTL23Q86XA0 190 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SYCP3Q8IZU3 236 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 STKLD1Q8NE28 680 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 BEST2Q8NFU1 509 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM3CQ92520 227 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 CPT1BQ92523 772 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 CCT6BQ92526 530 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SMARCD2Q92925 531 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ELSPBP1Q96BH3 223 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 C3orf49Q96BT1 292 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SENP8Q96LD8 212 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR78Q96P69 363 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 GCNAQ96QF7 691 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 MECRQ9BV79 373 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PARVGQ9HBI0 331 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 MLXIPLQ9NP71 852 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 HEY2Q9UBP5 337 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 BAG5Q9UL15 447 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB23Q9ULC3 237 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TBX20Q9UMR3 447 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 DAPP1Q9UN19 280 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 NOTCH2Q04721 2471 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC26A0AVF1 554 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 MTMR11A4FU01 709 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 HMX3A6NHT5 357 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 MYMKA6NI61 221 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 OR6C75A6NL08 312 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 CYB561D2O14569 222 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 OGTO15294 1046 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 OAZ2O95190 189 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 VNN2O95498 520 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PRAMEF12O95522 483 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 KRT19P08727 400 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ODC1P11926 461 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PSMC3P17980 439 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 FCARP24071 287 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 GABRR2P28476 465 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXC13P31276 330 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 DDIT3P35638 169 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 GRK6P43250 576 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 CXCL12P48061 93 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 ME1P48163 572 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PCP4P48539 62 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PNLIPRP1P54315 467 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC12A2P55011 1212 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC37A1P57057 533 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TAS2R50P59544 299 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 DMWDQ09019 674 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 BFSP1Q12934 665 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR17Q13304 367 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 PON2Q15165 354 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC6Q16204 474 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-211ENST00000492895 KYAT1Q16773 422 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms