RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 CDK15Q96Q40 435 aa16.5■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 COPS8Q99627 209 aa16.5■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 APOL5Q9BWW9 433 aa16.5■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 ME2P23368 584 aa16.49■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF7Q14155 803 aa16.49■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.49■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.49■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.48■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 LAYNQ6UX15 382 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 EGFL8Q99944 293 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 OARD1Q9Y530 152 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 NR5A2O00482 541 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 TCF3P15923 654 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 HSPA7P48741 367 aa16.48■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 GTF2H2Q13888 395 aa16.48■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 KBTBD6Q86V97 674 aa16.48■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.48■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 RB1P06400 928 aa16.47■□□□□ 0.23
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TOM1-216ENST00000492723 TCEAL5Q5H9L2 206 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 DET1Q7L5Y6 550 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.47■□□□□ 0.23
TOM1-216ENST00000492723 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.47■□□□□ 0.23
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