RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CCNYQ8ND76 341 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CD180Q99467 661 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 SNX7Q9UNH6 387 aa20.38■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TLCD2A6NGC4 264 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ZNF185O15231 689 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 LDLRP01130 860 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 SPTBP11277 2137 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ARSEP51690 589 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GPS2Q13227 327 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GTF2H3Q13889 308 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 D2HGDHQ8N465 521 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 KCTD6Q8NC69 237 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 OR8K5Q8NH50 307 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TCTN2Q96GX1 697 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 NUDT9Q9BW91 350 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CHST8Q9H2A9 424 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 KCND1Q9NSA2 647 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ZNF711Q9Y462 761 aa20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 A6NL46 340 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 KCNK1O00180 336 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 KCNJ13O60928 360 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 SKILP12757 684 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 BPIP17213 487 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GSDMDP57764 484 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GBE1Q04446 702 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 PLCL1Q15111 1095 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GPR19Q15760 415 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GPR150Q8NGU9 434 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GDAP1Q8TB36 358 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 HDAC11Q96DB2 347 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TTC25Q96NG3 672 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 VPS35Q96QK1 796 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TRIB3Q96RU7 358 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ZNF670Q9BS34 389 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GPR83Q9NYM4 423 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.36■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 MYO1FO00160 1098 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GJC1P36383 396 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TYRO3Q06418 890 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 NR6A1Q15406 480 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 RPE65Q16518 533 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 MED25Q71SY5 747 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 AMZ2Q86W34 360 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CNTD1Q8N815 330 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 C19orf60Q96EN9 201 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 C5orf34Q96MH7 638 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 LRFN5Q96NI6 719 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 NLNQ9BYT8 704 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 THAP2Q9H0W7 228 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TCFL5Q9UL49 500 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 POLEQ07864 2286 aa20.35■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 OR5K3A6NET4 321 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 MEN1O00255 615 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 KRT86O43790 486 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 VAV2P52735 878 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 RRADP55042 308 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ITGA1P56199 1179 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB17Q13105 803 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 PDK2Q15119 407 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 IQCKQ8N0W5 287 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CPT1BQ92523 772 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.34■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CBX6O95503 412 aa20.33■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 CDK18Q07002 472 aa20.33■□□□□ 0.85
NELFE-210ENST00000491139 DMPKQ09013 629 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms