RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	RENBP	P51606	427 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TRAF2	Q12933	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	IL10RA	Q13651	578 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NPW	Q8N729	165 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PSKH2	Q96QS6	385 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SVIL	O95425	2214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJC6	O75061	913 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CBX6	O95503	412 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	AMD1	P17707	334 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PTPN4	P29074	926 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CETN2	P41208	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PTGIR	P43119	386 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	COPS2	P61201	443 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	IL10RB	Q08334	325 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF235	Q14590	738 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TAZ	Q16635	292 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	USP45	Q70EL2	814 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ALG3	Q92685	438 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	COX14	Q96I36	57 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	GPR87	Q9BY21	358 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MED13L	Q71F56	2210 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	APOL1	O14791	398 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	UBXN7	O94888	489 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PYGM	P11217	842 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SPTB	P11277	2137 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	TFDP2	Q14188	446 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RPS6KA1	Q15418	735 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	KAZN	Q674X7	775 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PLD5	Q8N7P1	536 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	AVL9	Q8NBF6	648 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	SMIM14	Q96QK8	99 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344	NF1	P21359	2839 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RBM3-208	ENST00000489344		A6NL46	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF185	O15231	689 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CST8	O60676	142 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CEACAM4	O75871	244 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PGLS	O95336	258 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PYGL	P06737	847 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PPP2R5E	Q16537	467 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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