RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYRFLQ96LU7 910 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf50Q9BV19 199 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMC7Q9H6L4 198 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD84Q9UIB8 345 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTN3A1O00481 513 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BAIAP3O94812 1187 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HGFP14210 728 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DIO3P55073 304 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT3A1Q6NUS8 523 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM25Q86YD3 366 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A9Q8IVM8 553 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADCY4Q8NFM4 1077 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOL5Q9BWW9 433 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELENONQ9NZV5 590 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF112Q9ULX5 631 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa15.34■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRXCR1A8MXD5 290 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAMBPO95630 424 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMC3P17980 439 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRM2Q14416 872 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAPRE2Q15555 327 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFP28Q8NHY6 868 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACOX2Q99424 681 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC68Q9H2F9 335 aa15.33■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf81A6NN90 581 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GUCA1CO95843 209 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PORP16435 677 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLD2P49005 469 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRMT2P55345 433 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HERVK_113P63132 956 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMUG1Q53HV7 270 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT80Q6KB66 452 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHFR2Q86XF0 187 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLG3Q92796 817 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BADQ92934 168 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO4A1Q96BD0 722 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRSQ13332 1948 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DYTNA2CJ06 578 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLOD2O00469 737 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANGPT2O15123 496 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A2O15244 555 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCK1P16333 377 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP6V1B2P21281 511 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STT3AP46977 705 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH15P55291 814 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM45BPQ6NSW5 357 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHSY3Q70JA7 882 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KREMEN2Q8NCW0 462 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM45AQ8TCE6 357 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIPC3Q8TF64 312 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAR2Q96K12 515 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RANBP9Q96S59 729 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMMD10Q9Y6G5 202 aa15.33■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AZIN1O14977 448 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTX2O75431 263 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIMP1P01033 207 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPN3P20807 821 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FDXRP22570 491 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIK3CGP48736 1102 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEAD2Q15562 447 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPGS2Q68CL5 300 aa15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms