RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489342.1

RAB4A-204, Transcript of RAB4A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 5

Gene RAB4A, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4A-204ENST00000489342 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.07□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TBX20Q9UMR3 447 aa5.07□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.07□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.07□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.07□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 NUP205Q92621 2012 aa5.07□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TRIP11Q15643 1979 aa5.07□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 LACTBL1A8MY62 500 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 J3QKU1 62 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 PIP5K1BO14986 540 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 DEXIO95424 95 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CDC25CP30307 473 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 AKT1P31749 480 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 RPL9P32969 192 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 THBS4P35443 961 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 IDUAP35475 653 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 OPRD1P41143 372 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 STAT6P42226 847 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 NAMPTP43490 491 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ME1P48163 572 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 IL9RQ01113 521 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ZNF33AQ06730 810 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 GPR17Q13304 367 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 STARD3Q14849 445 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ANKRD40Q6AI12 368 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 PIM3Q86V86 326 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CACUL1Q86Y37 369 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MCPH1Q8NEM0 835 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 SGCZQ96LD1 299 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 PLIN2Q99541 437 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TRIM4Q9C037 500 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 NLRC4Q9NPP4 1024 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 HEY2Q9UBP5 337 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MMP17Q9ULZ9 603 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MGAQ8IWI9 3026 aa5.06□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 SHROOM3Q8TF72 1996 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 OR6C75A6NL08 312 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 E9PMD0 336 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 H3BNX3 289 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CYB561D2O14569 222 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 HCRTO43612 131 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 UGDHO60701 494 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 OAZ2O95190 189 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ITGA5P08648 1049 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 SERPINF2P08697 491 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 KCNE1P15382 129 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CYP11B2P19099 503 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CYP2F1P24903 491 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 CCDC173Q0VFZ6 552 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 GRIK2Q13002 908 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 LY6DQ14210 128 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 KRT32Q14532 448 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 PDGFRLQ15198 375 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 FBXO43Q4G163 708 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 XKR4Q5GH76 650 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 WSCD1Q658N2 575 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 WDR93Q6P2C0 686 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 BEST2Q8NFU1 509 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 OLIG1Q8TAK6 271 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ASB12Q8WXK4 309 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 BICD1Q96G01 975 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 P2RY11Q96G91 374 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 GPR78Q96P69 363 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 STK33Q9BYT3 514 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 ASB3Q9Y575 518 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.05□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa5.04□□□□□ -1.6
RAB4A-204ENST00000489342 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms