RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DGKA	P23743	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	GRIK2	Q13002	908 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ITPK1	Q13572	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KDR	P35968	1356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NDUFS3	O75489	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DAB1	O75553	588 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	JRK	O75564	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SLC25A12	O75746	678 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MLYCD	O95822	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	UBA7	P41226	1012 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TAS2R38	P59533	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DCST1	Q5T197	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	APBB2	Q92870	758 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TTC14	Q96N46	770 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NCOR1	O75376	2440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SCAMP1	O15126	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	AMD1	P17707	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.53	□□□□□ -1.69
RPL21-208	ENST00000483765	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL21-208	ENST00000483765	PTPRC	P08575	1304 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL21-208	ENST00000483765	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL21-208	ENST00000483765		M0QZ24	198 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL21-208	ENST00000483765	BMPR1B	O00238	502 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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