RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482110.5

PBX1-208, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene PBX1, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-208ENST00000482110 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 TTC27Q6P3X3 843 aa22.1■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 OR2L2Q8NH16 312 aa22.1■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 GRK7Q8WTQ7 553 aa22.1■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.1■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 BFARQ9NZS9 450 aa22.1■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 NPY2RP49146 381 aa22.09■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 ITIH4Q14624 930 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 PCID2Q5JVF3 399 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 PHF19Q5T6S3 580 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 METRNLQ641Q3 311 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 USP53Q70EK8 1073 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa22.09■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 SLC46A1Q96NT5 459 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 TTC1Q99614 292 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.09■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 CCDC78A2IDD5 438 aa22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 SGTAO43765 313 aa22.08■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 GSTM4Q03013 218 aa22.08■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 NFE2L1Q14494 772 aa22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 NKAIN2Q5VXU1 208 aa22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 ARMC3Q5W041 872 aa22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 HM13Q8TCT9 377 aa22.08■■□□□ 1.13
PBX1-208ENST00000482110 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 SEMA6CQ9H3T2 930 aa22.08■■□□□ 1.13
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PBX1-208ENST00000482110 URB1O60287 2271 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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PBX1-208ENST00000482110 CCDC162PA2VCL2 907 aa22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 QSOX1O00391 747 aa22.07■■□□□ 1.12
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PBX1-208ENST00000482110 FOXN2P32314 431 aa22.07■■□□□ 1.12
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PBX1-208ENST00000482110 NSG1P42857 185 aa22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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PBX1-208ENST00000482110 KCNJ11Q14654 390 aa22.07■■□□□ 1.12
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PBX1-208ENST00000482110 PACS1Q6VY07 963 aa22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 HDAC10Q969S8 669 aa22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.07■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 A0A087WV48 116 aa22.06■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.06■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PBX1-208ENST00000482110 TNFSF15O95150 251 aa22.06■■□□□ 1.12
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