RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 GULP1Q9UBP9 304 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 COPS3Q9UNS2 423 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.94□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 WNK3Q9BYP7 1800 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 STK36Q9NRP7 1315 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PQC6 194 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PRR19A6NJB7 356 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 J3QRK9 145 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SNAP23O00161 211 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CTDSP2O14595 271 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ABCD4O14678 606 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 AIM2O14862 343 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SYN3O14994 580 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 RAD51CO43502 376 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SPAG6O75602 509 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 IDH1O75874 414 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CBX6O95503 412 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PTTG1O95997 202 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 BCL10O95999 233 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GH2P01242 217 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 OPN1LWP04000 364 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SERPINB2P05120 415 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PSKH1P11801 424 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SYKP43405 635 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 RAP1GAPP47736 663 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 OR1G1P47890 313 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CDH4P55283 916 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 DSC2Q02487 901 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 MGAT3Q09327 533 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GALNT2Q10471 571 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 BST2Q10589 180 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 KCNC3Q14003 757 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF273Q14593 569 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 UGT8Q16880 541 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 FSCBQ5H9T9 825 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM31Q5JXX7 168 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CGB2Q6NT52 195 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM65Q6PI78 240 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 BRAT1Q6PJG6 821 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 OGFOD3Q6PK18 319 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CLNKQ7Z7G1 428 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TAC4Q86UU9 113 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 HIPK1Q86Z02 1210 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TBC1D10CQ8IV04 446 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 DENND1CQ8IV53 801 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 Q8N1Y9 231 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 FANCBQ8NB91 859 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 LINC00301Q8NCQ3 95 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM52Q8NDY8 209 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 MCUQ8NE86 351 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 URGCPQ8TCY9 931 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 RAET1EQ8TD07 263 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 C10orf82Q8WW14 230 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SNX19Q92543 992 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ESR2Q92731 530 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 FBXL8Q96CD0 374 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ARHGEF26Q96DR7 871 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 MAGED4Q96JG8 741 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 C16orf92Q96LL3 132 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 C9orf72Q96LT7 481 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 EYA3Q99504 573 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SERPINI1Q99574 410 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 OSBPL8Q9BZF1 889 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ZYG11BQ9C0D3 744 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ZMYND12Q9H0C1 365 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ADAMTS10Q9H324 1103 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 RASSF1Q9NS23 344 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SMOXQ9NWM0 555 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TSPYL4Q9UJ04 414 aa5.93□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 MID2Q9UJV3 735 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms