RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	MCU	Q8NE86	351 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZNF592	Q92610	1267 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SLCO2A1	Q92959	643 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PEX13	Q92968	403 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZZEF1	O43149	2961 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902		A6NCN8	305 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MGAT4D	A6NG13	374 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TTI1	O43156	1089 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TCEA3	O75764	348 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	VIP	P01282	170 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	POLB	P06746	335 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MLN	P12872	115 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ACVR1	Q04771	509 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MAP9	Q49MG5	647 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	BCL7A	Q4VC05	210 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	USP53	Q70EK8	1073 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PCGF5	Q86SE9	256 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	JAML	Q86YT9	394 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MFSD3	Q96ES6	412 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SERPINB12	Q96P63	405 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KIFC1	Q9BW19	673 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SOX13	Q9UN79	622 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		17.43	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQM1	296 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	B4GAT1	O43505	415 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	VAPB	O95292	243 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	NSG1	P42857	185 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MAPK9	P45984	424 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	GPR3	P46089	330 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	FASLG	P48023	281 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PRLHR	P49683	370 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DMPK	Q09013	629 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ITIH4	Q14624	930 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ISX	Q2M1V0	245 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	AVL9	Q8NBF6	648 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OR2L2	Q8NH16	312 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	RDH14	Q9HBH5	336 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TREX1	Q9NSU2	369 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	AK5	Q9Y6K8	562 aa		17.42	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KLHL33	A6NCF5	533 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902		D6RAR5	112 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TAF4	O00268	1085 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SGTA	O43765	313 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	BRAF	P15056	766 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PAM	P19021	973 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	C2orf54	Q08AI8	447 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	METRNL	Q641Q3	311 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PIM3	Q86V86	326 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	WWP1	Q9H0M0	922 aa		17.41	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		17.41	■□□□□ 0.38

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