RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SYN1P17600 705 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TSPAN8P19075 237 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UGT1A6P19224 532 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EPORP19235 508 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ITGALP20701 1170 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UGT1A1P22309 533 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UGT1A4P22310 534 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UGT1A3P35503 534 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UGT1A5P35504 534 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GGT5P36269 586 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MMP12P39900 470 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SPINT3P49223 89 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AGTR2P50052 363 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 THOP1P52888 689 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EPHB1P54762 984 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PKNOX1P55347 436 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 CLCQ05315 142 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GRIK2Q13002 908 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SQLEQ14534 574 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RCN1Q15293 331 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DHCR24Q15392 516 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TGFBIQ15582 683 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PHKG1Q16816 387 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP6Q16828 381 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 BRAT1Q6PJG6 821 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GDPD4Q6W3E5 623 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZVU0 165 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DPPA4Q7L190 304 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD6Q86V97 674 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 AHI1Q8N157 1196 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LOC100653049A0A140TA62 436 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ASPDHA6ND91 283 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TTC34A8MYJ7 566 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UPK3BL1B0FP48 263 aa5.56□□□□□ -1.52
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