RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 MC4RP32245 332 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 MAPK10P53779 464 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 CDH17Q12864 832 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 POU6F1Q14863 301 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 NXPE1Q8N323 547 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 STYXQ8WUJ0 223 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 COPS8Q99627 209 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPN4-208ENST00000460289 MGAT4DA6NG13 374 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SUN1O94901 812 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 MAPK9P45984 424 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 LAMB3Q13751 1172 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SEPT6Q14141 434 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 C4orf22Q6V702 233 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 DET1Q7L5Y6 550 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 USP7Q93009 1102 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PRORYQ9H606 182 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CEP104O60308 925 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ETV5P41161 510 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SEMA5AQ13591 1074 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CLCA4Q14CN2 919 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 BCL7AQ4VC05 210 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 METRNLQ641Q3 311 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 OR2L2Q8NH16 312 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CRELD1Q96HD1 420 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 TAAR9Q96RI9 348 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 MROH6A6NGR9 719 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CCL22O00626 93 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 UBXN7O94888 489 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CCL4P13236 92 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ETS1P14921 441 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 AMD1P17707 334 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 TMPRSS3P57727 454 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 NFE2L1Q14494 772 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SSUH2Q9Y2M2 353 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 BPTFQ12830 3046 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 NBEAQ8NFP9 2946 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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PTPN4-208ENST00000460289 PRAMEF10O60809 474 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PSMA3P25788 255 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CD82P27701 267 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CXCR5P32302 372 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 CACNG1Q06432 222 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 TAS2R42Q7RTR8 314 aa22.54■■□□□ 1.2
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PTPN4-208ENST00000460289 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.54■■□□□ 1.2
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PTPN4-208ENST00000460289 A8MU76 341 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 C9orf172C9J069 976 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPN4-208ENST00000460289 ADRA1DP25100 572 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ACRV1P26436 265 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPN4-208ENST00000460289 RPE65Q16518 533 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 GPR155Q7Z3F1 870 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPN4-208ENST00000460289 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa22.52■■□□□ 1.2
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