RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428740.5

IMP4-204, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-204ENST00000428740 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 FDFT1P37268 417 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 XIAPP98170 497 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 MC2RQ01718 297 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 SPARCL1Q14515 664 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 PTPRCAPQ14761 206 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 METRNLQ641Q3 311 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 C4orf22Q6V702 233 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 OR2L2Q8NH16 312 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 STYXQ8WUJ0 223 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 COPS8Q99627 209 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 OR2AG2A6NM03 316 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 EFCAB7A8K855 629 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 A8MU76 341 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 H7C0S8 307 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 LDB2O43679 373 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 LIASO43766 372 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ANKRD34CP0C6C1 535 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 BRAFP15056 766 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ATP1A2P50993 1020 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CTSCP53634 463 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 BCL7AQ4VC05 210 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 MANEAQ5SRI9 462 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 FAM129CQ86XR2 697 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 DTX1Q86Y01 620 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 TRIM58Q8NG06 486 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ART4Q93070 314 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 SGF29Q96ES7 293 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 RAB33BQ9H082 229 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 WDR70Q9NW82 654 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 KCTD3Q9Y597 815 aa14.72□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 E7EVH7 732 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 AGRPO00253 132 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 C9P02748 559 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 GSTM1P09488 218 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 LMAN1P49257 510 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 TMPRSS15P98073 1019 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 GSTM4Q03013 218 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CDH17Q12864 832 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 OLIG2Q13516 323 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CLCA4Q14CN2 919 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CCNG2Q16589 344 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 XKR5Q6UX68 686 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 NXPE1Q8N323 547 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 C9orf72Q96LT7 481 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 TTC1Q99614 292 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.71□□□□□ -0.05
IMP4-204ENST00000428740 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 F8W8V4 182 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 AP3B1O00203 1094 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 TPH1P17752 444 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 NDUFS1P28331 727 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 MC4RP32245 332 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 GDF10P55107 478 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 CACNG1Q06432 222 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 GPR18Q14330 331 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 NFE2L1Q14494 772 aa14.7□□□□□ -0.06
IMP4-204ENST00000428740 TGIF1Q15583 401 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms