RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428361.5

CTDSP1-202, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-202ENST00000428361 FAM87AP0C7U9 286 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CHRNA4P43681 627 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RWDD2BP57060 319 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GPR18Q14330 331 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CHRNA6Q15825 494 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GPRC6AQ5T6X5 926 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 C11orf96Q7Z7L8 435 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 HEXDCQ8WVB3 486 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZFPM2Q8WW38 1151 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 UBXN4Q92575 508 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CD180Q99467 661 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CTRCQ99895 268 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.18■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CFAP99D6REC4 459 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PJA2O43164 708 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PRAMEF1O95521 474 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DLGAP3O95886 979 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 BRAFP15056 766 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FECHP22830 423 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RBL1P28749 1068 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 HADHAP40939 763 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MARCKSL1P49006 195 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 GFERP55789 205 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ADCY2Q08462 1091 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PLCL1Q15111 1095 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 IRGCQ6NXR0 463 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KMT5CQ86Y97 462 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TTC13Q8NBP0 860 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ACTL9Q8TC94 416 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ZNF398Q8TD17 642 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KRT35Q92764 455 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ULK4Q96C45 1275 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FICDQ9BVA6 458 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SPRY4Q9C004 299 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PDE7BQ9NP56 450 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OGFRQ9NZT2 677 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KCND3Q9UK17 655 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa15.17■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RBP3P10745 1247 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 NDUFS1P28331 727 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 STAT5AP42229 794 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ARL4DP49703 201 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CYP4F2P78329 520 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SEPT6Q14141 434 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SYCE1Q8N0S2 351 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CARFQ8N187 725 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OR6C1Q96RD1 312 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ASB8Q9H765 288 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 VPS37BQ9H9H4 285 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 APMAPQ9HDC9 416 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa15.16■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MGAT4DA6NG13 374 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 OR2AG2A6NM03 316 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 F5H423 210 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KCNN4O15554 427 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 UGT1A9O60656 530 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 UGT1A6P19224 532 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 TCN2P20062 427 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ITGALP20701 1170 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 UGT1A1P22309 533 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 UGT1A4P22310 534 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 SEPHS1P49903 392 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 ACY1Q03154 408 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KCNC4Q03721 635 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 CDC20Q12834 499 aa15.15■□□□□ 0.02
CTDSP1-202ENST00000428361 KCNAB2Q13303 367 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms